清政府获知日军侵台的消息后，特派船政大臣沈葆桢为钦差，办理台湾等处海防兼理各国事务大臣。沈葆桢主张在军事上加强戒备，调派武毅铭军13营分批渡台，驻防风山；又以福建水师兵轮6艘长泊澎湖。此时，侵台日军数千人局促于台岛南端一隅之地，已成骑虎之势，但又不甘心无所得而归，便寄希望于外交讹诈，最后，以抚恤、修路、建房等名目勒索50万两白银而撤兵。日本第一次尝到了越海侵略的甜头，遂以此次侵台为契机，悍然于1879年3月8日将琉球国吞并，使之成为明治政府黩武扩张政策的第一个牺牲品。